Kümes hayvanlarında mycoplasma gallisepticum'un tespiti için lam aglütinasyon, ELISA ve PCR testlerinin karşılaştırılması

dc.authoridDanışman: 0000-0003-4636-7791en_US
dc.authorid0000-0002-7761-7899en_US
dc.contributor.advisorTorlak, Emrah
dc.contributor.authorTekkalan, Mümtaz Recep
dc.date.accessioned2020-12-23T10:05:00Z
dc.date.available2020-12-23T10:05:00Z
dc.date.issued2020en_US
dc.date.submitted2020-05-21
dc.departmentNEÜ, Fen Bilimleri Enstitüsü, Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalıen_US
dc.descriptionYüksek Lisans Tezi.en_US
dc.description.abstractMycoplasma gallisepticum, kanatlı hayvan yetiştiriciliğinde önemli bir hastalık etkeni olarak tanımlanmaktadır. Tavuklarda kronik solunum yolu hastalığına, hindilerde enfeksiyöz sinüzite sebep olmaktadır. Yüksek mortaliteye sahip olmamasına rağmen diğer hastalıklarla kombine olduğunda büyük maddi hasarlara yol açmaktadır. Bu nedenle, etkenin en kısa zamanda ve en doğru yöntemle tespit edilmesi önemlidir. Bu çalışmada, 300 adet kanatlıya ait svab-doku örnekleri PCR testi, kan serumları ise serolojik testler için kullanılmıştır. Lam aglütinasyon testi ile 148 örnek pozitif, 152 örnek ise negatif olarak değerlendirilmiştir. ELISA testi ile 128 örnekten pozitif, 172 örnekten ise negatif sonuç elde edilmiştir. Svab-doku örneklerinin 180 adedinden M. gallisepticum spesifik DNA izole edilmiştir. Testlerin karşılaştırılmasında kullanılan Kappa metodunda, test sonuçları arasında iyi düzeyin üzerinde bir uyum saptanmamıştır. PCR pozitif örneklerin önemli bir bölümünü, trakeal svabların oluşturduğu tespit edilmiştir. Bu nedenle, hastalığın ileri döneminde yapılan PCR testleri için trakealardan svab alınmıştır. Hastalık belirtileri devam eden 100 kanatlıdan 21 gün sonra tekrar trakeal svab ve serum örnekleri alınmıştır. Bu örnekler ile gerçekleştirilen lam aglütinasyon testinde, 55 örnek pozitif, 45 örnek ise negatif olarak değerlendirilmiştir. ELISA testi ile 55 örnekten pozitif, 45 örnekten ise negatif sonuç elde edilmiştir. Svab-doku örneklerinin 75 adedinden M. gallisepticum spesifik DNA izole edilmiştir. Kappa metodu uygulandığında test sonuçları arasında önemli düzeyde uyum tespit edilmemiştir. Elde edilen sonuçlar M. gallisepticum tespitinde sadece bir metot kullanılmasının yeterli olmadığını ve serolojik test metotları ile elde edilen sonuçların PCR ile doğrulanması gerektiğini ortaya koymuştur. PCR ile elde edilen sonuçlar, PCR testi için trakeal svabların tercih edilmesi gerektiğini göstermiştir.en_US
dc.description.abstractMycoplasma gallisepticum is defined as an important disease causative agent in poultry farming. It causes chronic respiratory disease in chickens and infectious sinusitis in turkeys. Although it does not have high mortality, when combined with other diseases, it causes great financial damage. For this reason, it is important to identify the agent in the shortest time and with the most accurate method. In this study, swab-tissue and serum samples from 300 poultries were used for the PCR test and serological tests, respectively. According to the slide agglutination test, 100 serum sample was negative and 200 serum samples were evaluated as positive. ELISA test yielded positive results from 128 samples and negative results from 172 samples. M. gallisepticum specific DNA was isolated from 180 of the swab-tissue samples. In the Kappa method used for comparing the tests, there was no good correlation between the test results. It was determined that a significant part of the PCR positive samples consisted of tracheal swabs. Therefore, swabs from the trachea were taken for PCR tests in the progressive stage of the disease. Tracheal swab and serum samples were collected 21 days later from 100 poultries with disease symptoms. In the slide agglutination test performed with these samples, 55 samples were evaluated as positive and 45 samples as negative. With the ELISA test, positive results were obtained from 55 samples and negative results from 45 samples. M. gallisepticum specific DNA was isolated from 75 of the swab-tissue samples. When the Kappa method is applied, there is no significant agreement between the test results. The obtained results revealed that the results obtained with a single test method are questionable in the detection of M. gallisepticum and the results obtained with serological test methods should be confirmed by PCR. Results obtained with PCR showed, that tracheal swabs should be preferred for PCR testing.en_US
dc.identifier.citationTekkalan, M. R. (2020). Kümes hayvanlarında mycoplasma gallisepticum'un tespiti için lam aglütinasyon, ELISA ve PCR testlerinin karşılaştırılması. (Yayınlanmamış Yüksek Lisans Tezi). Necmettin Erbakan Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Moleküler Biyoloji ve Genetik Anabilim Dalı, Konya.en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12452/6596
dc.language.isotren_US
dc.publisherNecmettin Erbakan Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsüen_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectELISAen_US
dc.subjectKümes Hayvanlarıen_US
dc.subjectLam Aglütinasyon Testi (LAT)en_US
dc.subjectMoleküler Mikrobiyolojien_US
dc.subjectMycoplasma Gallisepticumen_US
dc.subjectSerolojien_US
dc.subjectPCRen_US
dc.subjectELISAen_US
dc.subjectMycoplasma Gallisepticumen_US
dc.subjectPoultryen_US
dc.subjectSerologyen_US
dc.subjectSerum Plate Agglutination (SPA)en_US
dc.subjectPCRen_US
dc.titleKümes hayvanlarında mycoplasma gallisepticum'un tespiti için lam aglütinasyon, ELISA ve PCR testlerinin karşılaştırılmasıen_US
dc.title.alternativeComparison of slide agglutination, ELISA and PCR tests for the detection of mycoplasma gallisepticum in poultryen_US
dc.typeMaster Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Yükleniyor...
Küçük Resim
İsim:
Mümtaz recep tekkalan.pdf
Boyut:
2.06 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Yüksek Lisans Tezi.
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama: