GBP2 ve GBP5 gen ekspresyon düzeylerinin COVID 19 prognozuna etkisi
Yükleniyor...
Tarih
2024
Yazarlar
Dergi Başlığı
Dergi ISSN
Cilt Başlığı
Yayıncı
Necmettin Erbakan Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü
Erişim Hakkı
info:eu-repo/semantics/openAccess
Özet
Aralık 2019'da Çin'in Wuhan kentinde ortaya çıkan ve günümüze kadar geçen sürede tüm dünyayı etkileyen COVID-19, halk sağlığına karşı oluşturduğu tehdide ek olarak küresel ölçekte sosyoekonomik pek çok soruna yol açtı. Hızla yayılan salgın milyonlarca kişinin ölümüne neden oldu. Bu anlamda salgının epidemiyolojisinin, enfeksiyonun patojenezinin ve viral etkenin özelliklerinin araştırılması ve etkin mücadele yöntemlerinin geliştirilmesi, ilk günden bu yana tüm dünyanın en önemli gündemini oluşturmaktadır. COVID-19 patojenezi konakçı hücreye giriş, replikasyon, invazyon, doğal-edinsel bağışık yanıt ve buna bağlı gelişen enflamasyon süreciyle şekillenmektedir. Bağışık yanıt ve enflamasyon tablosu patojenez sürecindeki en önemli unsurlardır. Bu bağlamda bu tez kapsamında, viral enfeksiyonların patojenezinde moleküler düzeyde biyokimyasal sinyalizasyonda etkin rol oynadığı bilinen guanilat bağlayıcı proteinlerin (GBP) COVID-19 patojenezindeki muhtemel rolünün araştırılması hedeflenmiştir. Bu hedef çerçevesinde COVID-19 klinik sınıfı hafif-orta-şiddetli-kritik olan hastalarda GBP2 ve GBP5 proteinlerinin gen ekspresyon düzeyleri incelenmiştir. Çalışmamıza 18-80 yaş aralığında 150 COVID-19 tanısı alan hasta ile benzer yaş aralığında ve benzer ko-morbid hastalıklara sahip 50 kontrol grubu hasta dahil edilmiştir. COVID-19 tanısı alan ve farklı klinik seyir gösteren hasta gruplarının kendi aralarında ve kontrol grubu ile GBP2 ve GBP5 ekspresyon düzeyleri qRT-PCR yöntemiyle araştırılarak kıyaslanmıştır. Elde edilen verilere göre COVID-19 tanılı farklı prognoz sergileyen hastalarda hastalığın şiddetine bağlı olarak GBP2 geninin ekspresyon düzeylerinin anlamlı düzeyde azaldığı görülmüştür. Bu bağlamda GBP2’nin ekspresyon düzeylerinin patogenezde rol oynadığı tahmin edilmektedir. Diğer taraftan GBP5 ekspresyon düzeyinde, kritik hasta grubundaki ılımlı artış dışında, gruplar arasında anlamlı bir farklılık olmadığı gözlemlenmiştir. Çalışmamızda elde ettiğimiz veriler, GBP2’nin COVID-19’un seyrinde belirleyici bir rol aldığını düşündürmektedir. Bu durumun COVID-19’un teşhisi ve tedavisinde GBP2 odaklı yeni yöntemlerin ve farklı klinik yaklaşımların geliştirilmesine yardımcı olabileceğini öngörmekteyiz. İlgili proteinlerin COVID-19'un patogenezindeki rolünü tam olarak anlamak ve terapötik müdahale hedefleri olarak potansiyellerini keşfetmek için daha fazla araştırmaya ihtiyaç vardır.
COVID-19, originating in Wuhan, China in December 2019, has led to several worldwide socioeconomic issues in addition to its public health hazard. The disease spread quickly and resulted in the deaths of millions of people. Since the beginning, the global focus has been on studying the epidemiology, pathophysiology, features of the virus, and developing effective strategies to control the pandemic. The pathophysiology of COVID-19 is influenced by its entrance into the host cell, replication, invasion, the innate immune response, and subsequent inflammation. Immune response and inflammation are crucial components in the pathogenesis process. This thesis intends to explore the potential involvement of guanylate-binding proteins (GBP) in the pathogenesis of COVID19, given their established significance in biochemical signalling at the molecular level in viral infections. The gene expression levels of GBP2 and GBP5 proteins were analysed in patients across different clinical classifications of COVID-19 severity. The trial comprised 200 COVID-19 patients aged 18 to 80 and 50 control group patients with comparable age range and comorbidities. Levels of GBP2 and GBP5 expression in patient groups with varying clinical courses of COVID-19 were compared to one other and to a control group using the qRT-PCR technique. The results shows a substantial drop in GBP2 gene COVID 19levels in COVID-19 patients with varying prognoses, based on illness severity. GBP2 expression levels are expected to influence the pathogenesis process in this setting. However, there was no significant variation in GBP5 expression level between the groups, except for a little rise in the severely sick patient group. Our study data indicates that GBP2 is involved in the progression of COVID-19. This is expected to help therapeutic strategies, such creating new GBP2-focused techniques for diagnosing and treating COVID-19. Additional study is required to comprehensively grasp the function of certain proteins in COVID-19 development and investigate their potential as targets for therapeutic intervention.
COVID-19, originating in Wuhan, China in December 2019, has led to several worldwide socioeconomic issues in addition to its public health hazard. The disease spread quickly and resulted in the deaths of millions of people. Since the beginning, the global focus has been on studying the epidemiology, pathophysiology, features of the virus, and developing effective strategies to control the pandemic. The pathophysiology of COVID-19 is influenced by its entrance into the host cell, replication, invasion, the innate immune response, and subsequent inflammation. Immune response and inflammation are crucial components in the pathogenesis process. This thesis intends to explore the potential involvement of guanylate-binding proteins (GBP) in the pathogenesis of COVID19, given their established significance in biochemical signalling at the molecular level in viral infections. The gene expression levels of GBP2 and GBP5 proteins were analysed in patients across different clinical classifications of COVID-19 severity. The trial comprised 200 COVID-19 patients aged 18 to 80 and 50 control group patients with comparable age range and comorbidities. Levels of GBP2 and GBP5 expression in patient groups with varying clinical courses of COVID-19 were compared to one other and to a control group using the qRT-PCR technique. The results shows a substantial drop in GBP2 gene COVID 19levels in COVID-19 patients with varying prognoses, based on illness severity. GBP2 expression levels are expected to influence the pathogenesis process in this setting. However, there was no significant variation in GBP5 expression level between the groups, except for a little rise in the severely sick patient group. Our study data indicates that GBP2 is involved in the progression of COVID-19. This is expected to help therapeutic strategies, such creating new GBP2-focused techniques for diagnosing and treating COVID-19. Additional study is required to comprehensively grasp the function of certain proteins in COVID-19 development and investigate their potential as targets for therapeutic intervention.
Açıklama
Doktora Tezi
Anahtar Kelimeler
Covid-19, Gen Ekspresyonu, Guanilat Bağlayıcı Proteinler (GBP), Prognoz, Gene Expression, Guanylate Binding Proteins (GBP), Prognosis
Kaynak
WoS Q Değeri
Scopus Q Değeri
Cilt
Sayı
Künye
Baba, A. Y. (2024). GBP2 ve GBP5 gen ekspresyon düzeylerinin COVID 19 prognozuna etkisi. (Yayımlanmamış doktora tezi). Necmettin Erbakan Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Konya.
