Yeni nesil dizilemenin herediter renal tübüler hastalıkların tanısındaki yeri

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.advisorGöktaş, Emine
dc.contributor.authorŞanal, Sümeyye
dc.date.accessioned2025-10-07T10:29:04Z
dc.date.available2025-10-07T10:29:04Z
dc.date.issued2025
dc.date.submitted2025
dc.departmentNEÜ, Meram Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Genetik Anabilim Dalı
dc.description.abstractAmaç: Kalıtsal renal tübüler hastalıklar, sıvı, elektrolit ve asit-baz dengesi bozuklukları ile seyreden, genetik ve fenotipik olarak heterojenite gösteren nadir bir hastalık grubunu oluşturur. Yeni Nesil Dizileme (NGS) teknolojileri, bu heterojen yapıyı anlamada ve birden fazla genin eşzamanlı analizini mümkün kılarak tanısal doğruluğu artırmada önemli bir araçtır. Bu çalışmada, merkezimizde değerlendirilen hastaların fenotipik özellikleri ile NGS verileri birlikte ele alınarak, Türk toplumunda gözlenen genetik varyasyonlar hakkında bilgi edinmek, genotip-fenotip ilişkisini daha iyi anlamak ve daha önce tanımlanmamış varyantları inceleyerek klinik veri ile korelasyonlarını değerlendirmek amaçlanmıştır. Yöntem: 2019–2023 yılları arasında Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Tıbbi Genetik Anabilim Dalı’na kalıtsal tübüler hastalık ön tanısı veya ilişkili klinik bulgular ile başvuran toplam 56 hastanın genetik analiz verileri retrospektif olarak incelenmiştir. Tüm hastalardan elde edilen DNA örnekleri, kalıtsal tübülopatilerle ilişkili genleri içeren hedefe yönelik NGS paneli ile analiz edilmiştir. Belirlenen dahil etme kriterlerini karşılayan 26 hastanın fenotipik ve genotipik verileri detaylı olarak değerlendirilmiş ve bu hastalar çalışma grubunu oluşturmuştur. Ayrıca, saptanan genetik varyantların aile içi segregasyonunu incelemek amacıyla Sanger dizileme veya hedefe yönelik NGS yöntemleri ile elde edilmiş veriler retrospektif olarak taranmıştır. Bulgular: Çalışma grubundaki 26 hastada, 12 farklı gende patojenik, olası patojenik ve önemi bilinmeyen varyant sınıflarına dahil olan toplamda 30 varyant tespit edilmiştir. Genetik tanı oranı ise %46,4 olarak belirlenmiştir. En sık saptanan kalıtsal tübülopati Gitelman sendromu olup, 10 hastada (%38,5) saptanmıştır. Bunu sırasıyla Bartter sendromu (4 hasta, %15,4), distal renal tübüler asidoz (3 hasta, %11,5), ailesel hipokalsiürik hiperkalsemi (2 hasta, %7,7) ve hipokalsemi (2 hasta, %7,7) izlemiştir. Ayrıca, beş olguda literatürde daha önce bildirilmemiş, “novel” varyantlara rastlanmıştır. Sonuç: Bu çalışmada, kalıtsal tübüler hastalıklarla ilişkili genlerde saptanan genetik varyantlar kapsamlı biçimde değerlendirilmiş; klinik önemi bilinmeyen ve literatürde daha önce bildirilmemiş varyantlar tartışılarak olası yeni genotip-fenotip korelasyonları ortaya konulmuştur. Elde edilen bulgular, mevcut literatüre katkı sağlamanın yanı sıra, kalıtsal tübülopatilerle ilgili gelecekte planlanacak araştırmalara, hastaların klinik yönetiminde ve tedavi stratejilerinin geliştirilmesinde yol gösterici olabilir.
dc.description.abstractAim: Inherited renal tubular disorders represent a rare group of diseases characterized by disturbances in fluid, electrolyte, and acid-base balance, exhibiting both genetic and phenotypic heterogeneity. Next-Generation Sequencing (NGS) technologies are valuable tools for understanding this heterogeneity and enhancing diagnostic accuracy by enabling the simultaneous analysis of multiple genes. This study aims to analyze the phenotypic features of patients evaluated at our center in conjunction with NGS data to gain insights into the genetic variations observed in the Turkish population, to understand genotype-phenotype correlations better, and to examine previously unreported variants in relation to clinical findings. Methods: The genetic analysis data of 56 patients referred to the Department of Medical Genetics at Necmettin Erbakan University, Faculty of Medicine, between 2019 and 2023 with a preliminary diagnosis of inherited tubular disorder or related clinical findings were retrospectively reviewed. DNA samples from all patients were analyzed using a targeted NGS panel covering genes associated with inherited tubulopathies. A total of 26 patients who met the inclusion criteria were evaluated in detail regarding their phenotypic and genotypic characteristics and constituted the study group. Additionally, data obtained through Sanger sequencing or targeted NGS were retrospectively examined to assess familial segregation of the identified genetic variants. Results: Among the 26 patients in the study group, a total of 30 variants classified as pathogenic, likely pathogenic, or of uncertain significance were detected across 12 different genes. The genetic diagnostic yield was determined to be 46.4%. The most frequently observed inherited tubulopathy was Gitelman syndrome, identified in 10 patients (38.5%), followed by Bartter syndrome (4 patients, 15.4%), distal renal tubular acidosis (3 patients, 11.5%), familial hypocalciuric hypercalcemia (2 patients, 7.7%), and hypocalcemia (2 patients, 7.7%). Additionally, five novel variants not previously reported in the literature were identified. Conclusion: This study presents a comprehensive evaluation of genetic variants identified in genes associated with inherited tubular disorders. It discusses both variants of uncertain clinical significance and previously unreported variants, thereby proposing potential new genotype-phenotype correlations. The findings not only contribute to the existing literature but may also inform future research and guide clinical management and the development of treatment strategies for inherited tubulopathies.
dc.identifier.citationŞanal, S. (2025). Yeni nesil dizilemenin herediter renal tübüler hastalıkların tanısındaki yeri. (Yayınlanmamış tıpta uzmanlık tezi) Necmettin Erbakan Üniversitesi, Tıp Fakültesi Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Tıbbi Genetik Anabilim Dalı, Konya
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12452/19836
dc.identifier.yoktezid958394
dc.language.isotr
dc.publisherNecmettin Erbakan Üniversitesi, Tıp Fakültesi
dc.relation.publicationcategoryTez
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.subjectKalıtsal Tübüler Hastalıklar
dc.subjectInherited Tubular Disorders
dc.subjectYeni Nesil Dizileme
dc.subjectNext-Generation Sequencing
dc.subjectGenotip-Fenotip Korelasyonu
dc.subjectGenotype-Phenotype Correlation
dc.subjectVariant
dc.subjectVaryant
dc.titleYeni nesil dizilemenin herediter renal tübüler hastalıkların tanısındaki yeri
dc.title.alternativeThe role of next-generation sequencing in the diagnosis of hereditary renal tubular disorders
dc.typeSpecialist Thesis

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
958394 Dr. Sümeyye ŞANAL TEZ.pdf
Boyut:
3.88 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.17 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Tez Koleksiyonu