Colorectal Cancer Risk in Relation to Hypoxia Inducible Factor-1 (Hif-1) and Von Hippel-Lindau (VHL) Gene Polymorphisms

Basit Öğe Kaydı
dc.authoridİlknur Çınar: 0000-0002-8763-0480
dc.authoridTevfik Küçükkartallar: 0000-0002-6326-4623
dc.authoridHatice Gül Dursun: 0000-0001-5115-4681
dc.contributor.authorDemirel, H. Saygın
dc.contributor.authorTaşdemir, Pelin
dc.contributor.authorÇetinkaya, Sümeyra
dc.contributor.authorÇınar, İlknur
dc.contributor.authorKüçükkartallar, Tevfik
dc.contributor.authorDursun, Gül
dc.date.accessioned2020-01-18T21:11:02Z
dc.date.available2020-01-18T21:11:02Z
dc.date.issued2017
dc.departmentNEÜ, Meram Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalıen_US
dc.departmentNEÜ, Meram Tıp Fakültesi, Cerrahi Tıp Bilimleri Bölümü, Genel Cerrahi Anabilim Dalıen_US
dc.description.abstractColorectal cancers (CRC) are among the four most frequently seen cancers in humans and are the second leading cause of cancer-related deaths. Hypoxia up regulates multiple genes involved in different steps of metastatic process, including angiogenesis, proliferation, migration, invasion, motility, adhesion and survival. Hypoxia Inducible Factor 1 (HIF-1) is a master regulator protein of cellular hypoxia-response and triggers the expression of above-mentioned metastatic-process genes. Von Hippel Lindau (VHL) is a protein that plays critical role in the response to hypoxia and product of a tumor suppressor gene. We studied three single nu-cleotide polymorphisms, rs11549465, rs11549467 in HIF-1 and rs779805 in VHL, and assessed their associations with CRC risk, clinicopathologic and demographic features and lifestyle, and tumor stage and grade of CRC patients and/or healthy controls. ARMS-PCR technique for genotyping of rs11549465 C T and rs11549467 GA and PCR-RFLP technique for genotyping of rs779805 AG were used. CT/TT genotypes of HIF-1 1772C T polymorphism were found to increase the risk of colorectal cancer in patients. Additionally, it was demon-strated via statistical analyses that higher age, male gender, cancer history in family, co-existing diseases, and exposure to white soil stands to be risk factors of colorectal cancer. No significant relation was found between patient’s TNM stages and distributions of genotype. The findings from our study demonstrates that, in addition to risk factors for colorectal can-cer, scanning CT/TT genotypes of HIF-1 C1772T polymorphism can be advantageous in early-diagnosis of colorectal cancer.en_US
dc.description.abstractKolorektal kanser insanda sık görülen dört kanser türü arasında yer alır ve ölüme götüren kanserler içerisinde ikinci sıradadır. Hipoksi, anjiogenez, proliferasyon, migrasyon, invazyon, adhezyon ve sağkalımı içeren metastatik süreçte rol alan pek çok geni kontrol eder. Birçok kanser türünün gelişmesinde etkili olduğu düşünülen HIF-1 gen proteini hücrenin hipoksiye cevabının anahtar regülatörüdür. VHL proteini tümör baskılayıcı bir genin ürünü olup, hipoksiye cevap yolağında önemli rol alır. Biz bu çalışmada, HIF-1 geninin rs11549465, rs11549467 polimorfizmleri ile VHL geninin rs779805 polimorfizmini ve ayrıca yaş, cinsiyet, ailede kanser öyküsü, sistemik hastalıklar, beyaz toprak maruziyeti, sigara ve alkol tüketimi ile CRC riski arasındaki ilişkiyi araştırdık. Çalışmaya, histolojik olarak teyit edilen CRC tanısı almış 92 hasta ile kontrol grubu olarak 101 birey katıldı. DNA izolasyonu için periferal kan kullanıldı. HIF-1 genindeki rs11549465 CT ve rs11549467 GA polimorfizm değişimlerini genotiplemek için ARMS-PZR; VHL rs779805 AG polimorfizm değişimini genotiplemek için PZR-RFLP moleküler tanı yöntemleri kullanıldı. Hasta grubunda, HIF-1 1772C T polimorfizminin CT/TT genotipleri CRC riski ile istatistiksel anlamda ilişkili bulundu. Ayrıca kanser öyküsü, ileri yaş, erkek cinsiyet, eşlik eden hastalıklar ve beyaz toprak maruziyetinin kolorektal kanser için birer risk faktörü olduğu istatistiksel analizlerle belirlendi. Hastaların TNM evreleri ile genotip dağılımları arasında belirgin bir ilişkiye rastlanmadı. Sonuç olarak, HIF-1 C1772T polimorfizminin CT/TT genotipleri, ailede kanser öyküsü ve beyaz toprak maruziyeti CRC için birer risk faktörüdür ve CT/TT genotipi kolorektal kanserin erken tanısında avantaj sağlayabilir bir risk belirteci olarak kullanılabilecektir.en_US
dc.identifier.citationÇınar, İ., Küçükkartallar, T., Demirel, H. S., Taşdemir, P., Çetinkaya, S., Dursun, G. (2017). Colorectal cancer risk in relation to hypoxia ınducible factor-1 (hif-1) and von hippel-lindau (VHL) gene polymorphisms. Uluslararası Hematoloji-Onkoloji Dergisi, 27, 1, 13-20.en_US
dc.identifier.doi10.4999/uhod.171674en_US
dc.identifier.endpage20en_US
dc.identifier.issn1306-133Xen_US
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.scopusqualityQ4en_US
dc.identifier.startpage13en_US
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.4999/uhod.171674
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TWpnM056UTBOQT09/colorectal-cancer-risk-in-relation-to-hypoxia-inducible-factor-1-hif-1-and-von-hippel-lindau-vhl-gene-polymorphisms
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12452/2241
dc.identifier.volume27en_US
dc.identifier.wosWOS:000398137100003en_US
dc.identifier.wosqualityQ4en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.indekslendigikaynakWeb of Scienceen_US
dc.indekslendigikaynakScopusen_US
dc.language.isoenen_US
dc.relation.ispartofUluslararası Hematoloji-Onkoloji Dergisien_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US]
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectColorectal cancer
dc.subjectHIF-1α
dc.subjectVHL
dc.subjectrs11549465
dc.subjectrs11549467
dc.subjectKolorektal kanser
dc.titleColorectal Cancer Risk in Relation to Hypoxia Inducible Factor-1 (Hif-1) and Von Hippel-Lindau (VHL) Gene Polymorphismsen_US
dc.title.alternativeKolorektal Kanser Riski ile Hipoksiyle İndüklenen Faktör-1 Alfa (HIF-1) ve Von Hippel-Lindau (VHL)en_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
Colorectal Cancer Risk in Relation to Hypoxia Inducible Factor-1 (Hif-1 ) and Von Hippel-Lindau (Vhl) Gene Polymorphisms.pdf
Boyut:
712.42 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin (Full Text)
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
Scopus İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
WoS İndeksli Yayınlar Koleksiyonu