İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda mikrorna, CCN2 ve TGF-β ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi

Basit Öğe Kaydı
dc.contributor.authorMetli, Kübra
dc.contributor.authorYıldırım, Mahmut Selman
dc.date.accessioned2022-03-31T10:29:06Z
dc.date.available2022-03-31T10:29:06Z
dc.date.issued2021en_US
dc.date.submitted2021
dc.departmentNEÜ, Meram Tıp Fakültesi, Dahili Tıp Bilimleri Bölümü, Tıbbi Genetik Anabilim Dalıen_US
dc.description.abstractAmaç: MiRNA’lar biyolojik süreçlerde ve İPF gibi fibrotik hastalıklarda rol alan küçük RNA molekülleridir. Son yıllarda yapılan çalışmalar; vücut sıvılarında tespit edilebileceğini, hastalıkların tanı ve takiplerinde belirteç olarak kullanılabileceğini göstermektedir. Bu projede amaç; İPF hastalarında fibrotik süreçten sorumlu olabilecek CCN2 ve TGF-β genlerinin ve 21 miRNA’nın ekspresyon düzeylerinin periferik kanda qPCR yöntemiyle değerlendirilmesidir. Yöntem: Göğüs hastalıkları ana bilim dalı multidisipliner interstisyel akciğer hastalıkları konseyinde değerlendirilmiş ve İPF tanısı almış 20 kişilik hasta grubu ile 20 sağlıklı gönüllüden alınan periferik kan örneklerinde qPCR ile CCN2, TGF-β ve miRNA ekspresyon analizleri yapıldı. Bulgular: CCN2, TGF-β genlerinin ve miR’lerin ekspresyon düzeyleri belirlenerek hasta ve kontrol grubu arasındaki fark istatistiksel yöntemler ile incelendi. TGF-β, miR29a/29b/29c-3p, miR-19a, miR-130a-3p, miR-140-5p, miR-320a, miR-155-5p, miR-21-5p, miR-205-5p ekspresyonları hasta grubunda downregüle bulundu, miR-143-3p ekspresyonu ise upregüle bulundu. CCN2, miR-145, miR-30a/30b/30d/30e-5p, miR-26a-5p, miR-32-5p, miR-19b-1, miR-133 ve let-7d gruplar arasında ekspresyon farkı göstermedi. Hastalarda miR-29a-3p ve miR-140-5p’nin sigara kullanımı ile; miR-155-5p, miR-140-5p ve miR320a’nın cinsiyete göre ekspresyon farkı sergilediği saptandı. miR-29a ve miR-143 ile lojistik regresyon modeli oluşturuldu, ROC analizi ile miR-29a ve miR-143’ün hasta ve kontrol grubunu ayırt etme gücü istatistiksel olarak yüksek bulundu. Sonuç: Çalışmamızda, gen ve miRNA disregülasyonunun İPF hasta serumlarında RTqPCR gibi kolay ve rutin bir yöntemle tespit edilebileceği gösterilmiş; tanı, takip ve ilaç yanıtı değerlendirmede kullanımının mümkün olabileceği tartışılmıştır. Literatüre katkı sağlayacak yeni bulgular tespit edilmiş olup, bu bulgular ışığında yapılacak yeni çalışmalara yön verecektiren_US
dc.description.abstractBackground/Aim: MiRNA’s are small RNA molecules that participate many biological processes and fibrotic diseases like IPF. Studies carried out in recent years; shows that it can be detected in body fluids and can be used as a marker in the diagnosis and follow-up of diseases. Aim in this project is evaluation of expression levels of CCN2 and TGF-β genes and 21 miRNA’s that can be responsible for the fibrotic process of IPF, using RTqPCR in peripheral blood samples. Methods: CCN2, TGF-β and miRNA expression levels were analyzed using qPCR in peripheral blood samples of 20 patients and 20 healthy volunteers. All of the patients were diagnosed of IPF in the multidiciplinary interstitial pulmonary diseases counsil of the chest diseases department. Result: Any alteration of the expression levels of CCN2, TGF-β genes and miRNA’s were statistically analyzed. It is revealed that; TGF-β, miR-29a/b/c-3p, miR-19a, miR-130a-3p, miR-140-5p, miR-320a, miR-155-5p, miR-21-5p, miR-205-5p expression levels were downregulated in the patients; in contrast to miR-143-3p expression, which was upregulated. CCN2, miR-145, miR-30a/b/d/e-5p, miR-26a-5p, miR-32-5p, miR-19b-1, miR-133 and let-7d showed no statistically significant difference between patient and control groups. It was demonstrated; miR-29a and miR-140 expressions were altered due to whether the patient was a smoker, while miR-155, miR-140 and miR-320a expressions showed gender differences. Logistical regression model with miR-29a and miR-143 expression profiles were created. It was demonstrated that; strength of differentiating case and control groups were statistically higher in miR-29a and miR-143, with ROC analysis. Conclusion: In this study; we demonstrated that, gene and miRNA dysregulations in blood samples of IPF patients could easily be detected by routinely used RT-qPCR method. The potentiality of them being used in diagnosis, follow-up and drug responsiveness was discussed. Our project will contribute to the literature with new findings and guide the other invetigators in this field.en_US
dc.identifier.citationMetli, K. (2021). İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda mikrorna, CCN2 ve TGF-β ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi. (Yayınlanmamış tıpta uzmanlık tezi) Necmettin Erbakan Üniversitesi, Meram Tıp Fakültesi Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Tıbbi Genetik Anabilim Dalı, Konya.en_US
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12452/8155
dc.language.isotren_US
dc.publisherNecmettin Erbakan Üniversitesi Meram Tıp Fakültesien_US
dc.relation.publicationcategoryTezen_US
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectİPFen_US
dc.subjectMikroRNAen_US
dc.subjectCCN2en_US
dc.subjectTGF-βen_US
dc.subjectRT-qPCRen_US
dc.subjectSerumen_US
dc.subjectIPFen_US
dc.subjectMicroRNAen_US
dc.subjectCCN2en_US
dc.subjectTGF-βen_US
dc.subjectRT-qPCRen_US
dc.subjectSerumen_US
dc.titleİdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda mikrorna, CCN2 ve TGF-β ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesien_US
dc.title.alternativeEvaluation of microrna, CCN2 and TGF-β expression levels in patients with idiopathic pulmonary fibrosisen_US
dc.typeSpecialist Thesisen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
694244.pdf
Boyut:
3.18 MB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
İndir
Lisans paketi
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim Yok
İsim:
license.txt
Boyut:
1.44 KB
Biçim:
Item-specific license agreed upon to submission
Açıklama:
İndir

Koleksiyon

Dahili Tıp Bilimleri Bölümü Tez Koleksiyonu