High-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High Resolution Physical Map in Button Mushroom (Agaricus bisporus) Genome

Basit Öğe Kaydı
dc.authoridAli Tevfik Uncu: 0000-0003-4729-5750
dc.authoridAyşe Özgür Uncu: 0000-0001-6435-579X
dc.contributor.authorUncu, Ali Tevfik
dc.contributor.authorÖzgür Uncu, Ayşe
dc.date.accessioned2020-01-18T21:11:01Z
dc.date.available2020-01-18T21:11:01Z
dc.date.issued2018
dc.departmentNEÜ, Fen Fakültesi, Moleküler Biyoloji ve Genetiken_US
dc.departmentNEÜ, Fen Fakültesi, Biyoteknoloji Bölümüen_US
dc.description.abstractButton mushroom [Agaricus bisporus (J.E. Lange) Imbach], is both a model organism and a worldwide cultivated edible mushroom species. Despite its scientific and economic relevance, efforts to develop molecular markers in A. bisporus genome are scarce and relatively recent. The present research reports the development of 3943 novel simple sequence repeat (SSR) markers specific to the A. bisporus genome. The marker set is well-distributed among the 13 A. bisporus chromosomes, saturating the entire genome with sequence-specific markers. The large number of novel, A. bisporus specific DNA markers introduced in the present work constitute a valuable resource for molecular genetic research in button mushroom, including strain identification and protection, and gene/QTL (Quantitative Trait Locus) mapping.en_US
dc.description.abstractKültür mantarı [Agaricus bisporus (J.E. Lange) Imbach], bir model organizma olmasının yanı sıra dünya genelinde yetiştirilen bir yenilebilir mantar türüdür. Bilimsel ve ekonomik önemine rağmen A. bisporus genomuna özel moleküler markör geliştirme çalışmaları ancak yakın zamanda gerçekleştirilmeye başlanmış olup, oldukça kısıtlı sayıdadır. Bu çalışma kapsamında A. bisporus genomuna özel 3943 adet yeni basit dizi tekrarı (SSR) markörü geliştirilmiştir. Geliştirilen markörler A. bisporus kromozomlarına dengeli şekilde dağılmakta olup, genomun sekans-spesifik markörler ile doyurulmasını sağlamaktadır. Çalışma kapsamında tanıtılmakta olan yüksek sayıdaki A. bisporus’a özel yeni DNA markörü, bu türde gerçekleştirilecek moleküler genetik çalışmalar için kıymetli bir kaynak teşkil edecektir.en_US
dc.identifier.citationUncu, A. T., Özgür Uncu, A. (2018). High-throughput genomic simple sequence repeat (SSR) marker development and construction of a high resolution physical map in button mushroom (agaricus bisporus) genome. Mantar Dergisi, 9, 1, 28-35.en_US
dc.identifier.doi10.30708/mantar.391682en_US
dc.identifier.endpage35en_US
dc.identifier.issn2147-6845en_US
dc.identifier.issn2147-6845en_US
dc.identifier.issue1en_US
dc.identifier.startpage28en_US
dc.identifier.urihttps://dx.doi.org/10.30708/mantar.391682
dc.identifier.urihttps://app.trdizin.gov.tr/makale/TWpnME9UTXlNZz09/high-throughput-genomic-simple-sequence-repeat-ssr-marker-development-and-construction-of-a-high-resolution-physical-map-in-button-mushroom-agaricus-bisporus-genome
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12452/2225
dc.identifier.volume9en_US
dc.indekslendigikaynakTR-Dizinen_US
dc.language.isoenen_US
dc.relation.ispartofMANTAR DERGİSİen_US
dc.relation.publicationcategoryMakale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanıen_US]
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBiyolojien_US
dc.titleHigh-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High Resolution Physical Map in Button Mushroom (Agaricus bisporus) Genomeen_US
dc.title.alternativeKültür Mantarı (Agaricus bisporus) Genomuna Özel Yüksek Miktarda Basit Dizi Tekrarı (SSR) Markörünün Geliştirilmesi ve Yüksek Çözünürlükte Fiziksel Genom Haritasının Oluşturulmasıen_US
dc.typeArticleen_US

Dosyalar

Orijinal paket
Listeleniyor 1 - 1 / 1
Küçük Resim
İsim:
High-Throughput Genomic Simple Sequence Repeat (SSR) Marker Development and Construction of a High Resolution Physical Map in Button Mushroom (Agaricus bisporus) Genome.pdf
Boyut:
190.11 KB
Biçim:
Adobe Portable Document Format
Açıklama:
Tam Metin (Full Text)
İndir

Koleksiyon

TR-Dizin İndeksli Yayınlar Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu
Makale Koleksiyonu